飞哥与小佛的时空大冒险

意外闯入的时空裂缝

故事发生在一个看似平常却暗藏玄机的日子。泰瑞来到飞哥与小佛家已经整整五周年了，为了纪念这个特别的日子，飞哥亲手制作了一台大型鸭嘴兽羽毛球机器，两人兴高采烈地坐在里面，准备好好庆祝一番。然而命运偏偏喜欢开玩笑，阴错阳差之下，他们竟撞上了正背着两人驾驶火箭车出任务的泰瑞。巨大的冲击力让飞哥和小佛连同机器一起弹飞出去，最终跌跌撞撞地落进了杜芬舒斯的家中。就这样，飞哥与小佛第一次正式结识了这位总想统治三州地区的疯狂科学家，并出于善意帮他修好了被撞烂的“超时空终结者”。就在此时，泰瑞匆匆闯入杜芬舒斯家，为了不被家中主人发现自己的真实身份，他只好立刻变回那只毫无威胁性的鸭嘴兽模样。机器修好后，一行人无意间启动了超时空终结者，被卷入了一个截然不同的时空。

独眼杜芬舒斯的黑暗统治

他们来到的这个世界令人不寒而栗。三州地区被一个身穿黑袍、只有一只眼睛的杜芬舒斯独裁统治着，而原本正义凛然的莫来管队长，竟成了独眼杜芬舒斯手下的助理。更糟糕的是，这个时空的鸭嘴兽泰瑞早已被独眼杜芬舒斯改造，变成了忠于他的邪恶部属。在混乱之中，泰瑞迫不得已暴露了自己秘密特务的身份，这让飞哥感到非常难以接受。他一直把泰瑞当作家人，而家人之间是不该有秘密的。独眼杜芬舒斯随即命令机械鸭嘴兽向泰瑞发起攻击，经过一番激烈的缠斗，泰瑞暂时甩掉了对手，却决定独自去对付独眼杜芬舒斯，结果不幸失败被俘。飞哥一心想要回到自己的时空，可时空终结者的遥控器偏偏失灵了。无奈之下，他们只好去寻找这个时空里的自己，却发现另一个飞哥与本人判若两人，毫无想象力，甚至连暑假是什么都不知道。

反抗军与另一个自己

失望之余，他们又去找那个时空的伊莎贝拉，惊讶地发现她竟然是杜芬反抗军的一名军官。而飞哥的朋友们在这个时空里也都成了反抗军的一员，更令人意外的是，凯蒂斯居然是反抗军的头领。另一方面，独眼杜芬舒斯听杜芬舒斯讲述了另一个三州地区的情况后，野心勃勃地想利用时空终结者到飞哥原本的时空进行大规模侵略。可杜芬舒斯偏偏忘了怎么启动机器，独眼杜芬舒斯只好拿手上的鸭嘴兽泰瑞当人质，把飞哥他们全都抓了过来。就在危急关头，杜芬舒斯忽然想起了改造的方法，成功开启了时空之门。然而独眼杜芬舒斯嫌弃杜芬舒斯过于懦弱，竟把他连同飞哥他们一起送去喂怪兽。千钧一发之际，那个时空的凯蒂斯及时赶到，救下了他们，并利用时空之门展开了一场惊心动魄的大逃亡。

重返家园与最终决战

逃回自己的时空后，他们发现独眼杜芬舒斯的机器大军已经入侵了家园。于是众人找到藏在家里的密道，发现了鸭嘴兽泰瑞留下的秘密武器，原来正是飞哥他们在暑假里做的所有发明。两个时空的人齐心协力，用飞哥的发明合力击退了独眼杜芬舒斯的机械军团。飞哥摧毁了机器人的主控制台，让所有机器人全部当机，而鸭嘴兽泰瑞也打败了机械泰瑞，消除了它的邪恶思想。杜芬舒斯则用独眼杜芬舒斯最心爱的玩具火车头，把他引回了属于他的时空，最终被反抗军和莫来管联手擒获。然而因为泰瑞暴露了自己的身份，必须被遣往别处。凯尔建议用杜芬舒斯的记忆终结者消除大家的记忆。飞哥觉得这一连串经历实在太过精彩，舍不得删除，但小佛提醒他，美好的记忆可以自己创造，而泰瑞只有一只。于是他们最终选择删除记忆，一切又恢复了正常。在记忆被删除之前，伊莎贝拉轻轻亲了飞哥一下，为这段奇妙的冒险留下了一个温柔的句点。